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Imagerie 3D en biologie

Rendu du groupe de travail "Imagerie 3D en biologie" accès en intranet (à venir)

L’imagerie 3D du matériel biologique n’est plus une hypothèse mais arrive à la porte de nos centres de microscopie ou, pour certains, est déjà une application concrète. Cependant, pour qui n’a pas encore d’expérience en la matière, une certaine appréhension peut naître quant aux aspects pratiques liés à l’acquisition relative d’images en microscopie électronique (dans son centre ou dans un centre extérieur) et à l’étape de reconstruction 3D. Il peut également s’avérer utile de disposer d’un ensemble complet d’informations pour préparer au mieux son échantillon biologique pour l’imagerie 3D ou même interpréter une image tridimensionnelle. Comme tout développement innovant en microscopie, la mise en œuvre de l’imagerie 3D pour une application concrète de tous les jours au niveau d’un centre commun de microscopie nécessite donc une phase préalable de réflexion et de recherche d’informations pour argumenter les parties : Acquisition pour l’imagerie 3D en microscopie électronique à balayage : Principe de fonctionnement ; Méthodes de préparations appropriées d’échantillons biologiques ; Modes d’acquisition d’images. Acquisition pour l’imagerie 3D en microscopie électronique à transmission / tomographie tiltée et non tiltée : Principe de fonctionnement ; Méthodes de préparations appropriées d’échantillons biologiques ; Mode d’acquisition d’images. Réalisation d’une reconstruction 3D à partir de séries d’images de microscopie électronique : exploitation et comparaison entre les différentes solutions logicielles à disposition.

Participants

Anselme-Bertrand Isabelle

Balor Stéphanie :

Ben Younès Aména

Errazuriz Elisabeth

Frebourg Ghislaine

Gaillard Cédric coordinateur

Grodet Alain

Hermel Jean-Michel

Jaurand Xavier

Mallet Romain

Mesmer-Dudons Nathalie

Raynal Pierre-Yvan

Rivoire Annie

Sizaret Pierre-Yves

Spiegelhalter Coralie

Stephant Nicolas